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PacBio - RNA Sequencing

RNA kann mit dem PacBio System nicht direkt sequenziert werden, sondern wird zunächst in cDNA umgeschrieben. Durch die langen reads ist es jedoch möglich, alternative Spleißvarianten vollständig zu detektieren und zu unterscheiden. Je nach Größe der zu untersuchenden Templates kann ein size-selection Schritt notwendig sein. Ein size-selection Schritt ist in der Regel nicht notwendig, es können aber bei Bedarf kurze oder lange Transkripte durch selektive Bead-Aufreinigungen angereichert werden. Die Ergebnisse können u.a. zur Genomannotation oder zur Detektion seltener Transkripte verwendet werden. Eine quantitative Analyse ist zurzeit noch nicht möglich. Für ein humanes Transkriptom wird in der Regel eine Sequel II SMRT Cell verwendet.

Bitte beachten Sie unsere Probenanforderungen:

Verantwortlichkeit: