QC-Analysen
Das GTL kann Sie bei quantitativen und qualitativen QC-Analysen Ihrer DNA und RNA-Proben unterstützen. Hierfür stehen am GTL verschiedene Geräte zur Verfügung. Quantitative Analysen können sowohl spektrophotometrisch (NanoDrop), als auch nukleinsäurespezifisch mit einem fluorometrischen Assay (Qubit) erfolgen.
Qualitative Analysen werden mit Hilfe von Kapillargelelektrophoresesystemen durchgeführt. Integritätsanalysen von RNA-Proben führen wir mit einem Fragmentanalyzer (Advanced Analytical Technologies) durch.
Für die qualitative Analyse von genomischer DNA kommt der Fragment Analyzer zum Einsatz. Hier können Fragmentgrößen bis 50.000 bp gut bestimmt werden. Für die Analyse von hoch-molekularer gDNA können Fragmente bis zu einer Größe von 165 kb auf dem Femto Pulse System analysiert werden.
Zudem können der Erfolg von RNA-Amplifikationen, RNA-Fragmentierungen im Rahmen der Microarray-Analytik und die Qualität von NGS-Bibliotheken mit oben genannten Systemen überprüft werden.
Die jeweils aktuellen Kosten können Sie auf unserer Preisübersicht nachsehen.
Folgende Optionen für die QC stehen Ihnen zur Verfügung
FAQ - QC-Analysen
Proben für den den Fragment Analyzer sollten in mindestens 5 µl Wasser oder Elutionspuffer bereitgestellt werden. Achten Sie dabei bitte darauf, dass die Konzentration passend zu dem von Ihnen beauftragten Assay-Typ eingestellt worden ist! Das Handling der Proben wird vor Ort minimiert und die einzelnen Proben werden weder nachgemessen noch werden weitere Verdünnungen durchgeführt. Für Fehlmessungen aufgrund falscher Probenkonzentration kommen wir daher nicht auf.
Qualitative (Femto & Fragment Analyzer) und quantitative (Qubit) Analysen Ihrer Proben führen wir in der Regel innerhalb von zwei Arbeitstagen durch.
Die Ergebnisse der QC werden Ihnen als pdf-Datei bzw. als Excel-Datei nach Abschluss des Auftrages per eMail zugesandt.
Bereits analysierte Proben werden nach Bereitstellung der Ergebnisse maximal fünf Werktage bei -20°C gelagert und anschließend entsorgt. Sollten Sie die Rückgabe der Proben wünschen, vermerken Sie dies bitte auf dem entsprechenden Blockzettel bzw. holen Sie Ihre Proben direkt nach Abschluss der Analysen wieder bei uns ab.
GENERELL GILT: Stellen Sie uns bitte NUR ALIQUOTS für die Analyse zur Verfügung!
Wir können natürlich auch prokaryotische und pflanzliche Proben untersuchen. Geben Sie uns dazu bitte bei der Probenabgabe einen entsprechenden Hinweis, damit der Fragment Analyzer dahingehend konfiguriert werden kann (zur korrekten Identifikation der zusätzlichen plastidären rRNA bzw. der korrekten Identifikation der 16S- bzw. 23S rRNA und Vergabe einer entsprechenden RIN).