Qualitative QC-Analysen
Für die qualitative Beurteilung von Nukleinsäure Proben (DNA und RNA) steht dem GTL der FragmentAnalyzer (AATI) zur Verfügung. Die Analyse von hochmolekularer gDNA erfolgt auf dem Femto Pulse. Diese Plattformen arbeiten mit Fluoreszenzfarbstoffen und sind deshalb sehr sensitiv, so dass auch geringe Konzentrationen an Nukleinsäuren analysiert werden können.
Um Misserfolge zu vermeiden, achten Sie bitte bei der Probenvorbereitung auf die Einhaltung der u.g. Konzentrationsbereiche für den jeweiligen Assay, da die Konzentrationen von uns vorab idR nicht überprüft werden. Das minimale Probenvolumen sollte dabei 5 µl nicht unterschreiten.
Fragment Analyzer
| Assay | Art | Konzentration | Sizing range [bp] | Proben /Lauf |
|---|---|---|---|---|
| DNF-471 Standard Sensitivity RNA Assay | totalRNA | 10 - 500 ng/µl | 200 - 6.000 | 1 - 11 |
| mRNA | 10 - 500 ng/µl | |||
| DNF-472 High Sensitivity RNA Assay | totalRNA | 250 - 5.000 pg/µl | 200 - 6.000 | 1 - 11 |
| mRNA | 500 - 5.000 pg/µl | |||
| DNF-474 High Sensitivity NGS Fragment Analysis Kit | definierter Peak | 50 - 500 pg/µl | 100 - 6.000 | 1 - 11 |
| smear analysis | 250 - 5.000 pg/µl | |||
| DNF-464 High Sensitivity Genomic large fragment 50kb DNA Analysis Kit | smear analysis | 50 - 5.000 pg/µl gDNA (Optimum 1ng/µl) | 75 - 48.500 | 1 - 11 |
Femto Pulse
| Assay | Art | Konzentration | Sizing range [kbp] | Proben /Lauf |
|---|---|---|---|---|
| gDNA 165 kb (FP-1002) | hochmolekulare gDNA | 0,1 - 0,3 ng/µl | 1.3 - 165 | 1 - 11 |
Formalitäten
Bitte nutzen Sie zur Beauftragung unser TSM System. Dort können Sie nach erfolgter Registrierung ihre Analysen in Auftrag geben. Bitte geben Sie die vorbereiteten Proben zusammen mit einem Blockzettel (die Probeninformation wird direkt im TSM System eingegeben) in Geb. 22.07 Ebene U1, Raum 61 ab.
Wichtig: Bitte vermerken Sie auf dem Blockzettel die Auftragsnummer, die Sie im TSM System erhalten haben.
Nach der Analyse werden die Ergebnisse per Email an die im TSM hinterlegte eMail-Adresse zur Verfügung gestellt. Die Ergebnisse werden als PDF-Datei bereitgestellt.